Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD1Q9NXG2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms