Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
ATAD3AQ9NVI7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATAD3AQ9NVI7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms