Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LMBRD1Q9NUN5 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms