Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE7

ABCC13, Putative ATP-binding cassette sub-family C member 13, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC13Q9NSE7 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ABCC13Q9NSE7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms