Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SALL1Q9NSC2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SALL1Q9NSC2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms