Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS26

SPANXA1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome A, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXA1Q9NS26 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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SPANXA1Q9NS26 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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SPANXA1Q9NS26 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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SPANXA1Q9NS26 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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SPANXA1Q9NS26 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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SPANXA1Q9NS26 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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SPANXA1Q9NS26 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SPANXA1Q9NS26 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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