Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSPNQ9HAW4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms