Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCSER1Q9C0I3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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