Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SEMA4CQ9C0C4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms