Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXQ1Q9C009 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms