Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

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Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AL356417.2-202ENST00000608986 532 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CNTNAP3Q9BZ76 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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CNTNAP3Q9BZ76 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CNTNAP3Q9BZ76 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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