Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM54Q9BYV2 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms