Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms