Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CARD11Q9BXL7 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CARD11Q9BXL7 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms