Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
NICN1Q9BSH3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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