Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ3

GORASP1, Golgi reassembly-stacking protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GORASP1Q9BQQ3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GORASP1Q9BQQ3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GORASP1Q9BQQ3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms