Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ELF4Q99607 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ELF4Q99607 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms