Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CSF3RQ99062 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms