Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms