Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SGCZQ96LD1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SGCZQ96LD1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SGCZQ96LD1 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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