Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRIQ1Q96JM4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRIQ1Q96JM4 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms