Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
STAMBPL1Q96FJ0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
STAMBPL1Q96FJ0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms