Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCDC97Q96F63 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms