Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SDCCAG3Q96C92 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SDCCAG3Q96C92 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 466.7 ms