Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SH3KBP1Q96B97 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms