Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
BHMTQ93088 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms