Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EDAQ92838 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EDAQ92838 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EDAQ92838 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDAQ92838 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDAQ92838 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDAQ92838 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDAQ92838 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDAQ92838 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDAQ92838 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
EDAQ92838 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EDAQ92838 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms