Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NR4A3Q92570 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NR4A3Q92570 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NR4A3Q92570 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms