Protein–RNA interactions for Protein: Q92544

TM9SF4, Transmembrane 9 superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF4Q92544 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM9SF4Q92544 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms