Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BRSK1Q8TDC3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
BRSK1Q8TDC3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms