Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATL2Q8NHH9 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATL2Q8NHH9 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms