Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PIK3C3Q8NEB9 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PIK3C3Q8NEB9 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms