Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W8

FAM71D, Protein FAM71D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71DQ8N9W8 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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FAM71DQ8N9W8 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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FAM71DQ8N9W8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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FAM71DQ8N9W8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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FAM71DQ8N9W8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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FAM71DQ8N9W8 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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FAM71DQ8N9W8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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FAM71DQ8N9W8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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FAM71DQ8N9W8 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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FAM71DQ8N9W8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FAM71DQ8N9W8 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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