Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RAB11FIP4Q86YS3 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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RAB11FIP4Q86YS3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB11FIP4Q86YS3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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