Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CD163Q86VB7 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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