Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HAPLN4Q86UW8 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
HAPLN4Q86UW8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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