Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCDC80Q76M96 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms