Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPOCD1Q6ZMY3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPOCD1Q6ZMY3 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms