Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LRRC8EQ6NSJ5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms