Protein–RNA interactions for Protein: Q6KB66

KRT80, Keratin, type II cytoskeletal 80, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT80Q6KB66 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KRT80Q6KB66 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KRT80Q6KB66 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms