Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATG16L1Q676U5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms