Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM46CQ5VWP2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FAM46CQ5VWP2 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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