Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 FLJ40288-201ENST00000332558 1998 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
LINC01545Q5VT33 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms