Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 LINC01885-201ENST00000414300 609 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC090820.1-201ENST00000519722 591 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CEP350Q5VT06 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms