Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BRMS1LQ5PSV4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms