Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ODF2Q5BJF6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms