Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM259Q4ZIN3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms