Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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SP6Q3SY56 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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SP6Q3SY56 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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SP6Q3SY56 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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SP6Q3SY56 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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