Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
KLHL38Q2WGJ6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms