Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC142Q17RM4 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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